La estación Universitat Autònoma de las lineas S2 y S55 de los FGC entró en servicio en el año 1984 con el objetivo de poder dar servicio a los estudiantes universitarios de la zona. Inicialmente fue una estación terminal del ramal procedente de la estación de Bellaterra. En aquel entonces disponia de dos vías con sus respectivos andenes laterales que a continuación acababan en vía muerta.

En el año 1995, aprovechando que se construía la doble vía en la zona, se hizo una variante del trazado haciendo que todos los trenes que salian de Bellaterra pasaran por esta estación, para enlazar a continuación con la estación de Sant Quirze, de esta manera esta estación ya esta integrada dentro de la linea Barcelona-Sabadell. Actualmente esta estación está compuesta por dos vías y andenes laterales cubiertos por una marquesina metálica. Tiene varios accesos, por el lado norte y sur de la estación, y todos ellos estan dotados de máquinas de venta automática de billetes y de puertas de control de acceso a los andenes. Completan las instalaciones de la estación una vía muerta situada en el interior del túnel en dirección Sabadell.